El objetivo de las colecciones de fauna es documentar, por medio de los ejemplares conservados y la información asociada, la existencia de especies en una zona geográfica determinada. El aporte que estas colecciones hacen es innumerable y su aporte científico y social es cada vez más necesario y reconocido. Las colecciones tienen una función que va más allá de la conservación del patrimonio ya que son una herramienta esencial en la conservación de la biodiversidad y el estudio de procesos ecológicos y evolutivos.
Nuestra colección fue creada en 1988 por los prof. Gisela González Enei y Andrés Muñoz Pedreros y actualmente es curada por los prof. Pamela Sánchez Pérez y Basilio Guiñez Lillo. La colección cuenta con ejemplares de mamíferos, aves, anfibios, reptiles e invertebrados. Esta colección es utilizada tanto en las actividades de investigación como en las de docencia.